针灸理疗师证是一种专业的技能证书，持有该证书的人具备一定的理论知识和实践能力，可以在医疗机构从事针灸理疗工作，关于针灸理疗师证在医疗机构的使用问题，需要考虑以下几个方面：

1、法律法规：需要了解当地的法律法规对于针灸理疗师证在医疗机构的使用是否有明确的规定，不同国家和地区的法律法规可能有所不同，因此需要查阅相关法律文件，确保针灸理疗师证的合法性。

2、医疗机构的资质：需要考虑所在医疗机构是否具备合法的资质，只有经过政府部门批准的、具有合法执业资格的医疗机构才能聘请针灸理疗师，如果所在机构没有相应的资质，那么针灸理疗师证在医疗机构的使用可能会受到限制。

3、针灸理疗师的技能水平：还需要评估针灸理疗师的技能水平，虽然持有针灸理疗师证的人具备一定的理论知识和实践能力，但在实际工作中，他们可能还需要不断学习和提高自己的技能，医疗机构在聘请针灸理疗师时，可能会对候选人的技能水平进行评估，以确保他们能够为患者提供高质量的服务。

4、患者的需求和期望：还需要考虑患者的需求和期望，有些患者可能对针灸理疗有很高的期望值，希望能够在专业、有经验的针灸理疗师的指导下进行治疗，医疗机构在聘请针灸理疗师时，可能会优先考虑那些具有较高技能水平和丰富经验的人选。

针灸理疗师证可以在医疗机构使用，但需要考虑多方面的因素，包括法律法规、医疗机构的资质、针灸理疗师的技能水平以及患者的需求和期望等，只有在这些条件都满足的情况下，针灸理疗师证才能在医疗机构发挥其应有的作用。