心理咨询师证书发证机关是指负责颁发心理咨询师资格证书的政府部门或机构，心理咨询师证书的发放主要由以下几个部门或机构负责：

1、中国国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC):作为中国政府的卫生和健康主管部门，NHC负责制定和实施心理咨询师职业资格认证的政策、法规和标准，NHC下设的职业技能鉴定中心(原劳动保障部职业技能鉴定中心)负责心理咨询师职业资格的鉴定工作。

2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各地卫生健康委员会在NHC的指导下，负责本地区的心理咨询师职业资格认证工作，各地卫生健康委员会会同当地的人力资源和社会保障局(原劳动和社会保障局)共同组织实施心理咨询师职业资格鉴定考试。

3、中国科学院心理研究所：作为中国心理学研究的重要机构，中国科学院心理研究所在心理咨询师职业资格认证工作中发挥着重要作用，研究所会定期组织心理咨询师职业资格鉴定考试，并对考试成绩进行审核、备案。

4、其他专业培训机构：除了上述政府部门和机构外，一些专业的心理咨询培训机构也会开展心理咨询师职业资格培训和认证工作，这些机构需要向NHC申请设立心理咨询师职业资格培训和认证项目，经过审批后方可开展相关工作。

在填写心理咨询师证书发证机关时，您需要根据自己的实际情况选择相应的单位，如果您是通过正规途径参加培训并通过考试获得心理咨询师资格证书的，那么您应该填写NHC、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会或者中国科学院心理研究所等发证机关，如果您是通过其他专业培训机构获得心理咨询师资格证书的，那么您需要填写该培训机构所在的发证机关。

在填写相关信息时，请确保您的个人信息准确无误，包括姓名、性别、出生日期、身份证号等，您还需要提供相关的证明材料，如学历证书、培训证书、考试成绩单等，在提交申请后，您可以关注相关部门的公告，了解证书发放的具体时间和地点，希望以上信息对您有所帮助。