针灸师证是由国家卫生健康委员会颁发的，这是目前公认的最权威的证书，不同的部门颁发的针灸师证可能会有所不同，主要体现在以下几个方面：

1、权威性：国家卫生健康委员会是中国政府的主管部门，其颁发的针灸师证具有最高的权威性，其他部门如中医药管理局、职业技能鉴定中心等也有一定的权威性，但其权威性可能不如国家卫生健康委员会。

2、适用范围：不同部门的针灸师证可能适用于不同的范围，国家卫生健康委员会的针灸师证在全国范围内有效，而其他部门的针灸师证可能只在特定的地区或行业内有效。

3、考试内容和标准：不同部门的针灸师证考试内容和标准可能会有所不同，国家卫生健康委员会的针灸师证考试内容更为全面，标准更为严格。

4、培训和考核：不同部门的针灸师证培训和考核方式可能会有所不同，国家卫生健康委员会的针灸师证培训通常由专业的医疗机构进行，考核方式更为严谨；而其他部门的针灸师证培训和考核可能由非专业的机构进行，考核方式可能较为宽松。

5、证书的含金量：从社会认可度和就业前景来看，国家卫生健康委员会的针灸师证的含金量通常更高，这是因为国家卫生健康委员会的针灸师证具有最高的权威性，被广大用人单位和社会公众广泛认可。

6、费用：不同部门的针灸师证考试费用可能会有所不同，国家卫生健康委员会的针灸师证考试费用较高，但考虑到其证书的含金量和就业前景，这个费用是值得的。

虽然不同部门的针灸师证可能会有所不同，但从权威性、适用范围、考试内容和标准、培训和考核、证书的含金量以及费用等方面来看，国家卫生健康委员会的针灸师证无疑是最好的选择，如果你打算考取针灸师证，建议你选择国家卫生健康委员会的针灸师证。

考取针灸师证并不是一件容易的事情，需要付出大量的时间和精力，你需要对中医基础理论和针灸专业知识有深入的了解和掌握；你需要通过严格的考试，包括笔试和实操考试；你还需要通过实习和考核，证明你具备实际的临床操作能力，如果你打算考取针灸师证，你需要做好充分的准备，提前规划好学习计划，坚持不懈地学习和实践。