中医针灸理疗师证的颁发部门有很多，其中比较权威的有国家中医药管理局、卫生部人才交流服务中心、中华中医药学会等，这些部门都是经过国家相关部门批准设立的，具有一定的权威性和认可度，不过，不同的部门对于针灸理疗师证的考核内容和标准也有所不同，因此在选择颁发部门时需要根据自己的实际情况进行综合考虑。

国家中医药管理局是国务院直属事业单位，负责全国中医药行业的管理和监督工作，该部门颁发的针灸理疗师证书具有较高的权威性和认可度，是从事针灸理疗工作的必备证书之一，卫生部人才交流服务中心则是由国家卫生计生委直接领导的事业单位，主要负责全国医疗卫生人才的培养、选拔、使用和管理等工作，该部门颁发的针灸理疗师证书也是非常有含金量的，并且在医疗行业内也有很高的知名度，中华中医药学会则是中国最大的中医药学术组织之一，其颁发的针灸理疗师证书也是非常有分量的。

无论选择哪个部门颁发的中医针灸理疗师证，都需要认真备考和参加考试，以确保自己能够顺利通过并获得相应的资质认证，在选择颁发部门时也需要考虑到该部门对于针灸理疗行业的认知程度、专业水平以及历史背景等因素，从而选择最适合自己的颁发部门。