针灸师证书是由多个国家和地区的专业机构颁发的，包括中国、美国、加拿大、澳大利亚等，针灸师证书主要由以下几个部门颁发：

1、国家中医药管理局：国家中医药管理局是中华人民共和国国务院直属的一个部门，负责全国中医药事业的管理和发展，该局设立了针灸师资格考试，通过考试并符合条件的人员可以获得针灸师资格证书。

2、中国中医科学院针灸研究所：中国中医科学院针灸研究所是中国著名的针灸科学研究机构，其下设有针刺研究室、灸法研究室等实验室，该研究所也会组织针灸师资格考试，为合格者颁发针灸师证书。

3、其他省级中医药管理部门：除了国家中医药管理局外，各省、自治区、直辖市也设有相应的中医药管理部门，负责本地区的中医药管理工作，这些部门也会组织针灸师资格考试，并为合格者颁发证书。

在美国，针灸师证书主要由美国针灸医学院(American Academy of Acupuncture and Oriental Medicine,简称AAOM)颁发，AAOM是美国最权威的针灸教育机构之一，其颁发的针灸师证书具有很高的国际认可度，要获得AAOM的针灸师证书，申请人需要完成一定数量的学分课程，并通过笔试和实践操作考核。

在加拿大，针灸师证书主要由加拿大皇家医学院(Royal College of Physicians and Surgeons of Canada,简称RCPSC)颁发，RCPSC是加拿大最大的医学协会之一，其颁发的针灸师证书被加拿大各省份广泛认可，要获得RCPSC的针灸师证书，申请人需要参加由RCPSC组织的认证课程，并通过笔试和实践操作考核。

在澳大利亚，针灸师证书主要由澳大利亚针灸与中医学联合会(Australian College of Acupuncture and Chinese Medicine,简称ACOC)颁发，ACOC是澳大利亚最具权威的针灸教育机构之一，其颁发的针灸师证书被澳大利亚各州政府广泛认可，要获得ACOC的针灸师证书，申请人需要参加由ACOC组织的认证课程，并通过笔试和实践操作考核。

针灸师证书的颁发机构因国家和地区而异，通常包括国家级中医药管理部门、国家级针灸教育机构以及其他相关机构，要获得针灸师证书，申请人需要满足一定的学分要求，并通过严格的笔试和实践操作考核，获得针灸师证书后，可以在医疗机构、保健中心等场所从事针灸治疗工作。