心理咨询师证书的发放主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)负责，各省、自治区、直辖市也设有相应的心理咨询师考试管理机构，这些机构负责组织和实施心理咨询师职业资格考试，对考试合格者颁发心理咨询师资格证书。

心理咨询师证书的发放流程大致如下：

1、报名参加心理咨询师职业资格考试：考生需要在规定的时间内通过指定的网络平台进行报名，填写个人信息并缴纳考试费用，报名成功后，考生需按照要求参加培训课程，学习相关理论知识和技能。

2、参加考试：考试通常分为笔试和实践操作两个部分，笔试主要测试考生的理论知识，实践操作则测试考生的实际操作能力和沟通技巧，考试成绩达到一定标准的考生方可参加实践操作考试。

3、获得实习资格：通过实践操作考试的考生需要在指定的机构进行实习，积累一定的工作经验，实习期间，考生需要接受导师的指导，并完成一定的实习任务。

4、考核和颁发证书：实习期满后，考生需要接受导师的考核，考核合格的考生可获得心理咨询师职业资格证书，证书上注明了考生的姓名、性别、出生日期、身份证号、专业类别、级别等信息，以及发证机构的名称和印章。

5、继续教育和执业登记：获得心理咨询师证书后，考生需要参加一定的继续教育活动，以更新知识和技能，考生还需要在规定的时间内到相关部门进行执业登记，领取执业证书，执业证书上注明了考生的姓名、性别、出生日期、身份证号、专业类别、级别、执业范围等信息，以及发证机构的名称和印章。

需要注意的是，不同国家和地区对心理咨询师证书的发放和管理可能存在差异，心理咨询师证书的发放和管理主要由国家卫生健康委员会负责，而在其他国家，如美国，心理咨询师证书的发放和管理可能涉及到美国心理学会(APA)等专业组织，在申请心理咨询师证书时，考生需要了解所在国家或地区的相关规定和要求。