心理咨询师证书发证机关是指负责颁发心理咨询师专业资格证书的政府部门或事业单位，心理咨询师证书的发证机关主要有以下几个：

1、中国心理卫生协会(CPA)

中国心理卫生协会(Chinese Psychiatric Association,简称CPA)是由国家卫生健康委员会主管的全国性专业社会组织，成立于1953年，中国心理卫生协会下设多个专业委员会，负责组织和开展心理咨询师的专业培训、考试、认证等工作，根据《心理咨询师职业资格标准》，经过中国心理卫生协会组织的心理咨询师培训和考试合格者，可以获得中国心理卫生协会颁发的心理咨询师资格证书。

2、中国心理学会(CPS)

中国心理学会(Chinese Psychological Society,简称CPS)是由中国科学院主管的全国性学术组织，成立于1956年，中国心理学会下设多个专业委员会，负责组织和开展心理咨询师的专业培训、考试、认证等工作，根据《心理咨询师职业资格标准》，经过中国心理学会组织的心理咨询师培训和考试合格者，可以获得中国心理学会颁发的心理咨询师资格证书。

3、其他地方政府人力资源社会保障部门

除了上述两个主要的发证机关外，各省、自治区、直辖市的人力资源和社会保障部门也会组织开展心理咨询师的培训和考试工作，这些地方性的人力资源管理部门会与当地的心理健康服务机构合作，共同推动心理咨询师职业的发展，在这些地区，参加由当地人力资源和社会保障部门组织的心理咨询师培训和考试合格者，也可以获得相应的心理咨询师资格证书。

4、国际认可的心理咨询师证书机构

随着全球化的发展，越来越多的国际心理咨询师证书机构进入中国市场，这些机构通常与各国的专业组织合作，提供国际化的心理咨询师培训和考试服务，虽然这些机构的证书在国际上具有一定的认可度，但在中国境内，其证书的发证机关和权威性可能不如中国心理卫生协会和中国心理学会颁发的证书，在选择心理咨询师证书时，建议考生综合考虑各种因素，选择具有较高权威性和认可度的证书。

心理咨询师证书发证机关主要包括中国心理卫生协会、中国心理学会以及各省、自治区、直辖市的人力资源和社会保障部门等，还有一些国际认可的心理咨询师证书机构在中国提供服务，在选择心理咨询师证书时，建议考生充分了解各种证书的特点和发证机关，以便做出明智的决策。