心理咨询师证书的颁发主要由国家卫生健康委员会（原卫生部）和人力资源和社会保障部（原劳动部）两个部门负责，这两个部门颁发的心理咨询师证书各有特点，但从整体来看，国家卫生健康委员会颁发的心理咨询师证书更具权威性和认可度。

从历史沿革来看，国家卫生健康委员会是最早负责心理咨询师培训和认证的部门，自20世纪80年代以来，国家卫生健康委员会就开始组织心理咨询师的培训和认证工作，积累了丰富的经验和资源，而人力资源和社会保障部在2000年以后才开始涉足心理咨询师的培训和认证工作，相对来说时间较短。

从培训质量来看，国家卫生健康委员会对心理咨询师的培训要求较高，培训内容涵盖心理学、心理咨询学、心理治疗学等多个领域，注重培养学员的实际操作能力和综合素质，而人力资源和社会保障部的培训内容相对较为简单，主要侧重于理论知识的传授，国家卫生健康委员会还与国内外知名高校和研究机构合作，邀请业内专家进行授课，确保培训质量。

从证书认可度来看，国家卫生健康委员会颁发的心理咨询师证书在业界具有较高的认可度，许多企事业单位、医疗机构、学校等在招聘心理咨询师时，都要求应聘者具备国家卫生健康委员会颁发的心理咨询师证书，而人力资源和社会保障部颁发的心理咨询师证书在认可度上相对较低。

从考试难度来看，国家卫生健康委员会的心理咨询师考试难度较大，考试内容涉及心理学、心理咨询学、心理治疗学等多个领域，对考生的知识储备和实际操作能力要求较高，而人力资源和社会保障部的心理咨询师考试难度相对较低，主要侧重于理论知识的考核，国家卫生健康委员会颁发的心理咨询师证书更能体现考生的专业水平和能力。

从职业发展来看，国家卫生健康委员会颁发的心理咨询师证书为考生提供了更广阔的职业发展空间，持有该证书的心理咨询师可以在医疗机构、学校、企事业单位等多个领域从事心理咨询工作，还可以申请成为注册心理治疗师、注册婚姻家庭咨询师等专业资格，而人力资源和社会保障部颁发的心理咨询师证书在职业发展方面相对较为局限。